Glyptotekets samling består primært af kunstværker og arkæologiske genstande fra det antikke Ægypten, de antikke græske og romerske verdener, den etruskiske kultur samt dansk og fransk kunst fra det 19. århundrede. Samlingen af antik skulptur rummer bl.a. en omfattende samling af antikke græske og romerske portrætter samt en stor samling af palmyrenske portrætter.

Heerup Museum rummer en helt unik samling af kunstneren Henry Heerups værker fra mere end 70 års produktion af maleri, grafik, litografi og skulptur. Gennem indsamling, registrering, bevaring, forskning og formidling udbreder museet sit kendskabe til Heerups liv og værk.